棉花红黄叶枯病多在初花期开始发病，盛花期至结铃期发生普遍而严重，吐絮期甚至一片片死亡。病叶自上而下，从里向外扩展。发病初期叶缘褪绿变黄，逐渐向内发展，使叶脉间产生黄色斑块，叶脉仍保持绿色，叶质增厚变脆，叶缘下垂，叶片上凸。有的全叶变为黄褐色很像黄萎病，但红（黄）叶枯病维管束不变色。结铃期，病叶先为黄色，然后产生红色斑点，最后全叶变红，严重的叶柄基部变软或失水干缩，形成茎枯，引起大量落叶，全株枯死。病叶脱落时，叶柄与茎秆连接处形成干缩的褐斑。自然条件下，不同田块表现不同症状类型，有黄叶型和红叶型，多数情况下两种兼有，同一棉株的叶片也会表现出不同颜色。病株根部发育不良，侧根少，发病早的棉株矮小。

棉红叶枯病是一种生理病害，其发生与水肥、土壤、气候和栽培管理密切相关，直接原因是氮、磷、钾元素含量不平衡，特别是缺少钾肥。   施肥：过多的依赖化肥，尤其是氮肥，而很少或不施用农家肥，多年连作，引起土壤质地下降，有机质含量少，营养结构不合理，引起钾元素的严重缺乏，从而影响棉花的正常生长。地膜棉田若底肥不足，前期旺长，后期脱肥，发病重。   环境：如遇高温干旱，水分和养分不能满足棉花的生长，同时也造成土壤中钾元素的固定而难以吸收．干旱愈久，发病愈重；棉花生长前期雨水多，地上部生长快，但根系浅，吸收养分能力差，也有利于发病。久旱后如遇暴雨或连阴雨也可引起该病的暴发。   土壤：砂性土壤、黏性土壤，以及高岗地、坑头地等耕作层浅的土壤发病重。   栽培：棉田长期连作、管理粗放，营养结构不合理，引起水肥供应失调，发病重；干旱季节棉田不能及时灌溉，前期施肥后棉株水肥供应不上，发病重。