芝麻青枯病发病初期茎部出现暗绿色斑块，以后颜色加深，呈黑褐色条斑，顶梢往往有2—3个梭形溃疡状裂缝。起初植株顶端萎蔫，后下部叶片凋萎，呈失水状，发病轻时夜间尚可恢复，数日后枯死。也有半边植株先萎蔫而另半边暂时维持原状的。病株较矮小，根茎维管束呈褐色，最后蔓延至髓部，造成空洞。湿度大时，茎部内外均有菌脓溢出。横切茎剖面，在切口的维管束组织中有白色的菌脓溢出。这是诊断青枯病的主要特征。   菌脓渐变为漆黑色晶亮的颗粒，病根变成褐色，细根腐烂。病叶叶脉呈墨绿色条斑，有时纵横交错，结成网状，对光观察，其中心呈透明油渍状。叶背的脉纹呈黄色波浪形扭曲突起，愈近叶缘，扭曲愈甚，后病叶褶皱或变褐枯死。蒴果发病，初现水浸状病斑，后逐渐变为深褐色粗细不匀的条斑，引起蒴果瘦小，内部种子瘦瘪呈污褐色，不能发芽。

Pseudomonas solanacearum称青枯假单胞菌，属细菌。

病菌主要随病残株在土壤中越冬。病菌对土壤的适应能力很强，能单独在土中存活并繁殖，可存活3—5年。条件适宜时，病菌从根部或茎基部伤口或自然孔口侵入。在田间，病菌主要通过灌溉水、雨水、地下害虫、农具或农事操作传播。病菌喜高温，田间地温12.8℃病菌开始侵染，在15－30℃范围内，温度越高，发病越重，因而发病高峰多在炎热的7—8月份。土壤潮湿利于病害发生，尤以暴风雨后骤晴，植株叶面蒸腾加大，病株导管内细菌迅速繁殖上升，阻塞导管使植株大量发病，且雨水对病菌的传播极为有利连作地病菌不断积累，发病日益加重。